More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3008 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
296 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  96.28 
 
 
296 aa  560  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3111  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  95.95 
 
 
296 aa  540  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0860517  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  82.27 
 
 
300 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75.77 
 
 
296 aa  427  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  76.69 
 
 
298 aa  427  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.04 
 
 
285 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.64 
 
 
272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.34 
 
 
291 aa  288  8e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.11 
 
 
275 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.71 
 
 
284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.85 
 
 
286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.27 
 
 
282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.34 
 
 
287 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.09 
 
 
291 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.85 
 
 
280 aa  279  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.65 
 
 
288 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.35 
 
 
282 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.85 
 
 
287 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.41 
 
 
300 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.27 
 
 
276 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.6 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.24 
 
 
281 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.57 
 
 
282 aa  262  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.03 
 
 
281 aa  258  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.03 
 
 
281 aa  258  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.39 
 
 
272 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.44 
 
 
280 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
276 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.32 
 
 
266 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.96 
 
 
266 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.77 
 
 
263 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.99 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.02 
 
 
262 aa  220  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.62 
 
 
269 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.29 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.29 
 
 
270 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.59 
 
 
266 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.75 
 
 
280 aa  218  8.999999999999998e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.11 
 
 
260 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.57 
 
 
265 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.21 
 
 
265 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.77 
 
 
271 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.69 
 
 
285 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.55 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.78 
 
 
268 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.78 
 
 
268 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.04 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.66 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.16 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.96 
 
 
266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.46 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.41 
 
 
302 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.58 
 
 
285 aa  210  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.52 
 
 
279 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.71 
 
 
292 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.4 
 
 
292 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.25 
 
 
275 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.4 
 
 
292 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.44 
 
 
261 aa  209  6e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1227  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.18 
 
 
261 aa  209  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0136152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.96 
 
 
264 aa  208  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.86 
 
 
276 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.87 
 
 
290 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.52 
 
 
273 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.73 
 
 
296 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3215  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.33 
 
 
291 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.023751 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3329  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.33 
 
 
291 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3149  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.33 
 
 
291 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.55 
 
 
273 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.51 
 
 
296 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.88 
 
 
267 aa  206  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.86 
 
 
302 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.25 
 
 
268 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.25 
 
 
268 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.25 
 
 
268 aa  205  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.25 
 
 
268 aa  205  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3166  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41 
 
 
291 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0961486  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.45 
 
 
268 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.6 
 
 
290 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0571  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.12 
 
 
266 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.6 
 
 
290 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.53 
 
 
290 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.6 
 
 
290 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3229  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41 
 
 
291 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228705 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.85 
 
 
256 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.01 
 
 
289 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.81 
 
 
269 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.28 
 
 
270 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.28 
 
 
283 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.39 
 
 
271 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.46 
 
 
269 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.46 
 
 
269 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.29 
 
 
271 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.46 
 
 
269 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.85 
 
 
256 aa  202  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.13 
 
 
267 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3940  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.63 
 
 
306 aa  201  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3602  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.63 
 
 
306 aa  201  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.189288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.43 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>