More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2213 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
296 aa  578  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.64 
 
 
292 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.94 
 
 
292 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.94 
 
 
292 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2649  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  65.85 
 
 
296 aa  345  6e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.635632  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.68 
 
 
302 aa  335  7e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3940  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.67 
 
 
306 aa  328  9e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3602  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.67 
 
 
306 aa  328  9e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.189288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3333  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.43 
 
 
309 aa  301  8.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614535  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.13 
 
 
272 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.68 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.89 
 
 
291 aa  248  7e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.8 
 
 
287 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.41 
 
 
291 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.92 
 
 
288 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.63 
 
 
285 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.85 
 
 
286 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.81 
 
 
274 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.45 
 
 
281 aa  231  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.45 
 
 
300 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.76 
 
 
284 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.73 
 
 
282 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.42 
 
 
282 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.57 
 
 
281 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.57 
 
 
281 aa  223  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.92 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.18 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.22 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.44 
 
 
266 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.79 
 
 
298 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.11 
 
 
266 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.55 
 
 
280 aa  218  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.84 
 
 
280 aa  218  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.18 
 
 
270 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45 
 
 
270 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.96 
 
 
272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.13 
 
 
261 aa  215  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.16 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.48 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.11 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.14 
 
 
282 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.4 
 
 
257 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.69 
 
 
296 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.75 
 
 
291 aa  209  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.13 
 
 
257 aa  208  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.29 
 
 
281 aa  207  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.51 
 
 
296 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.75 
 
 
287 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.06 
 
 
267 aa  205  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.81 
 
 
268 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.81 
 
 
268 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.52 
 
 
296 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.24 
 
 
276 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.18 
 
 
271 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0680  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.98 
 
 
299 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.72 
 
 
269 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.07 
 
 
263 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.17 
 
 
260 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.21 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.49 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.3 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.29 
 
 
268 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3111  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.52 
 
 
296 aa  198  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0860517  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.79 
 
 
274 aa  196  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.625021  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.1 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.62 
 
 
269 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.9 
 
 
265 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.13 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.13 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.71 
 
 
271 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.34 
 
 
260 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.64 
 
 
265 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.52 
 
 
269 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.24 
 
 
265 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.24 
 
 
262 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.81 
 
 
263 aa  192  4e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.52 
 
 
269 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.61 
 
 
276 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.1 
 
 
285 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.16 
 
 
271 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.07 
 
 
273 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.02 
 
 
263 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.52 
 
 
269 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.52 
 
 
269 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.37 
 
 
270 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.86 
 
 
266 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.72 
 
 
273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.59 
 
 
287 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.93 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.34 
 
 
283 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.89 
 
 
270 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.78 
 
 
268 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.59 
 
 
290 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.59 
 
 
290 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.59 
 
 
290 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.12 
 
 
268 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.12 
 
 
268 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.78 
 
 
268 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.52 
 
 
289 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.92 
 
 
290 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>