More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1877 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.54 
 
 
260 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.47 
 
 
257 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.92 
 
 
269 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.31 
 
 
260 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.31 
 
 
257 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1227  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.44 
 
 
261 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0136152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.15 
 
 
290 aa  265  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.17 
 
 
266 aa  265  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.33 
 
 
283 aa  261  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.1 
 
 
271 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.04 
 
 
267 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.82 
 
 
270 aa  258  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.72 
 
 
261 aa  258  8e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.97 
 
 
273 aa  258  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.78 
 
 
273 aa  257  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.04 
 
 
271 aa  257  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.34 
 
 
261 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.02 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.33 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.95 
 
 
266 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.89 
 
 
280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.61 
 
 
256 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.61 
 
 
256 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.78 
 
 
265 aa  248  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.91 
 
 
287 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.22 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.81 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.14 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.83 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.83 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.04 
 
 
269 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.96 
 
 
270 aa  241  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.78 
 
 
289 aa  241  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.93 
 
 
291 aa  240  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.19 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.33 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
266 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.44 
 
 
268 aa  239  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.83 
 
 
268 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.44 
 
 
268 aa  239  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.05 
 
 
268 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.05 
 
 
268 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.61 
 
 
268 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
275 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.81 
 
 
263 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.73 
 
 
268 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.85 
 
 
271 aa  234  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.73 
 
 
268 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51 
 
 
265 aa  234  9e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.73 
 
 
268 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.91 
 
 
290 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.24 
 
 
301 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.61 
 
 
261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.53 
 
 
270 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
281 aa  230  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.39 
 
 
290 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.53 
 
 
270 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.39 
 
 
290 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.78 
 
 
288 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.39 
 
 
290 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.2 
 
 
262 aa  229  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.04 
 
 
289 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.57 
 
 
265 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.86 
 
 
300 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.35 
 
 
269 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.19 
 
 
284 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.52 
 
 
300 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.33 
 
 
301 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.4 
 
 
287 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.81 
 
 
280 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.2 
 
 
285 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.37 
 
 
286 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.94 
 
 
296 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0543  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.37 
 
 
285 aa  226  3e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.8 
 
 
248 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.04 
 
 
289 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.87 
 
 
264 aa  226  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.94 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.94 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.94 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.94 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.94 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.94 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.94 
 
 
296 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0592  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.29 
 
 
280 aa  225  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801291  unclonable  2.22313e-18 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.55 
 
 
296 aa  225  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3632  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.58 
 
 
301 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.64 
 
 
296 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.64 
 
 
296 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.39 
 
 
269 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
271 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.4 
 
 
261 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.06 
 
 
271 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.4 
 
 
287 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.55 
 
 
298 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.45 
 
 
275 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.55 
 
 
296 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.55 
 
 
296 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.72 
 
 
276 aa  222  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>