More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3602 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009955  Dshi_3602  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
306 aa  607  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.189288 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3940  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
306 aa  607  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.54 
 
 
292 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.54 
 
 
292 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.19 
 
 
292 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2649  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  61.9 
 
 
296 aa  343  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.635632  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.67 
 
 
296 aa  340  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.1 
 
 
302 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3333  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.63 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614535  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
276 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.17 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.71 
 
 
282 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.41 
 
 
287 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.07 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.08 
 
 
282 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.66 
 
 
274 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.64 
 
 
300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.61 
 
 
279 aa  225  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.99 
 
 
288 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.03 
 
 
286 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.48 
 
 
291 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.35 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.91 
 
 
302 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.62 
 
 
287 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.9 
 
 
296 aa  215  7e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.03 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.1 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.5 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.5 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.1 
 
 
284 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.04 
 
 
296 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.52 
 
 
300 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.48 
 
 
298 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.42 
 
 
280 aa  209  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45 
 
 
296 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.29 
 
 
275 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.7 
 
 
291 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3111  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.71 
 
 
296 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0860517  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.89 
 
 
272 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.33 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.52 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.03 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.96 
 
 
268 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.41 
 
 
268 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.41 
 
 
268 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.5 
 
 
283 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.3 
 
 
257 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.21 
 
 
257 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.41 
 
 
268 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.52 
 
 
268 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.14 
 
 
269 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.89 
 
 
265 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.52 
 
 
268 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.14 
 
 
269 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.41 
 
 
260 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.54 
 
 
289 aa  192  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.8 
 
 
269 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.8 
 
 
269 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.52 
 
 
268 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0680  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.81 
 
 
299 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.5 
 
 
276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.54 
 
 
285 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.61 
 
 
261 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.89 
 
 
267 aa  188  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.03 
 
 
270 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.03 
 
 
270 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.38 
 
 
268 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.33 
 
 
260 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.75 
 
 
263 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.87 
 
 
301 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.96 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.56 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.52 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.11 
 
 
273 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.93 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.06 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.8 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.62 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.52 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.88 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.46 
 
 
301 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.34 
 
 
291 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.34 
 
 
291 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.34 
 
 
291 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.34 
 
 
291 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  38.34 
 
 
291 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.98 
 
 
274 aa  182  6e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.625021  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.34 
 
 
291 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.7 
 
 
270 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.34 
 
 
291 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.34 
 
 
291 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.34 
 
 
291 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000698602  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.38 
 
 
273 aa  182  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3329  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.49 
 
 
291 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3149  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.49 
 
 
291 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3215  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.49 
 
 
291 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.023751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.05 
 
 
296 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>