More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0641 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
274 aa  535  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.27 
 
 
272 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.82 
 
 
287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.12 
 
 
288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.96 
 
 
286 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.74 
 
 
291 aa  291  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.91 
 
 
296 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.18 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.62 
 
 
284 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.27 
 
 
280 aa  281  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.29 
 
 
300 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.76 
 
 
298 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.6 
 
 
296 aa  279  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.23 
 
 
296 aa  277  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.51 
 
 
276 aa  275  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.22 
 
 
285 aa  271  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.82 
 
 
275 aa  268  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3111  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.15 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0860517  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.6 
 
 
281 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.73 
 
 
281 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.44 
 
 
280 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.6 
 
 
281 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.31 
 
 
300 aa  262  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.61 
 
 
282 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.53 
 
 
282 aa  255  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.12 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.61 
 
 
272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.37 
 
 
276 aa  251  7e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.44 
 
 
282 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.57 
 
 
271 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.37 
 
 
263 aa  248  6e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.38 
 
 
279 aa  248  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.97 
 
 
257 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.47 
 
 
261 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.58 
 
 
262 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.38 
 
 
265 aa  244  9e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.35 
 
 
266 aa  244  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.79 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.91 
 
 
260 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.45 
 
 
266 aa  241  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.82 
 
 
266 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.85 
 
 
289 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.31 
 
 
285 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.15 
 
 
271 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.16 
 
 
291 aa  240  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.86 
 
 
265 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.81 
 
 
296 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.53 
 
 
273 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0680  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.75 
 
 
299 aa  238  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690592  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.54 
 
 
256 aa  238  8e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.38 
 
 
268 aa  237  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.38 
 
 
268 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.38 
 
 
269 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
268 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
268 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.62 
 
 
273 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.97 
 
 
292 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.97 
 
 
292 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.67 
 
 
267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.81 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
269 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.81 
 
 
276 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.15 
 
 
256 aa  234  9e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.95 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.62 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.68 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.45 
 
 
268 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.17 
 
 
290 aa  232  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.57 
 
 
280 aa  232  5e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.16 
 
 
270 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.04 
 
 
287 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
267 aa  231  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.53 
 
 
289 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.09 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.95 
 
 
292 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.37 
 
 
287 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.43 
 
 
261 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.62 
 
 
261 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52 
 
 
296 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.56 
 
 
263 aa  230  2e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.43 
 
 
261 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0592  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
280 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801291  unclonable  2.22313e-18 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.47 
 
 
262 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.15 
 
 
289 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.04 
 
 
291 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.04 
 
 
291 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.04 
 
 
291 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.04 
 
 
291 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.71 
 
 
301 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.04 
 
 
291 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000698602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.04 
 
 
291 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.04 
 
 
291 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.04 
 
 
291 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  47.04 
 
 
291 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.79 
 
 
268 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.79 
 
 
268 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.31 
 
 
266 aa  228  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.06 
 
 
267 aa  228  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>