More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3111 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3111  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
296 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0860517  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  99.66 
 
 
296 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  95.95 
 
 
296 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  82.98 
 
 
300 aa  474  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  76.11 
 
 
296 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.03 
 
 
298 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.02 
 
 
285 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.02 
 
 
272 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
291 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.36 
 
 
282 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.74 
 
 
275 aa  285  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.62 
 
 
284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.85 
 
 
286 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.98 
 
 
280 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.72 
 
 
291 aa  280  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.66 
 
 
287 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.43 
 
 
282 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.31 
 
 
288 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.84 
 
 
287 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.76 
 
 
300 aa  275  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.87 
 
 
274 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.52 
 
 
276 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.53 
 
 
281 aa  261  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.76 
 
 
272 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.21 
 
 
282 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.55 
 
 
281 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.55 
 
 
281 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.64 
 
 
280 aa  247  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.06 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.69 
 
 
266 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.32 
 
 
266 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.77 
 
 
263 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.76 
 
 
262 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.04 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.22 
 
 
266 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.57 
 
 
265 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.74 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.89 
 
 
271 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.57 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.26 
 
 
269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.84 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.84 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.76 
 
 
302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.74 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.65 
 
 
280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.4 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.4 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.62 
 
 
271 aa  212  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.86 
 
 
285 aa  211  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.91 
 
 
257 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.52 
 
 
279 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.8 
 
 
268 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.7 
 
 
266 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.28 
 
 
257 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.86 
 
 
275 aa  208  7e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.4 
 
 
292 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.4 
 
 
292 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.4 
 
 
276 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.3 
 
 
296 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.36 
 
 
292 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.26 
 
 
290 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.26 
 
 
290 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.26 
 
 
290 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.52 
 
 
273 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.43 
 
 
267 aa  206  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.9 
 
 
273 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.89 
 
 
264 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3215  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.33 
 
 
291 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.023751 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3329  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.33 
 
 
291 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3149  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.33 
 
 
291 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.52 
 
 
296 aa  205  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.65 
 
 
283 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.96 
 
 
261 aa  204  1e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1227  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.73 
 
 
261 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0136152 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.25 
 
 
268 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.25 
 
 
268 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.76 
 
 
271 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.25 
 
 
268 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3166  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40 
 
 
291 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0961486  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3229  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40 
 
 
291 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.01 
 
 
270 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.9 
 
 
268 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.65 
 
 
271 aa  202  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.11 
 
 
281 aa  202  5e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.75 
 
 
290 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.53 
 
 
302 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.81 
 
 
269 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.54 
 
 
290 aa  201  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0571  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.65 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.54 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0680  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.29 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.73 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.07 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.93 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.85 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.07 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.07 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3602  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.62 
 
 
306 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.189288 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3940  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.62 
 
 
306 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.4 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>