69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3795 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  100 
 
 		 113 aa  233  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  79.46 
 
 		 114 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  71.7 
 
 		 111 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  72.63 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  68.93 
 
 		 115 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  70.3 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  67.89 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  43.18 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  43.42 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  43.42 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  43.04 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  42.31 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  45.07 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  40.28 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  32.43 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  32.89 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  37.25 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2336  hypothetical protein  26.25 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  26.67 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1334  chemotactic signal-response protein CheL  29.29 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.406333  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0003  putative chemotactic signal-response protein CheL  29.29 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  28.95 
 
 		 605 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  35.9 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  33.33 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  30.43 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  34.94 
 
 		 178 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1034  hypothetical protein  37.23 
 
 		 210 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.68 
 
 		 400 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1129  hypothetical protein  37.23 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  35.62 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.73 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  34.18 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  29.57 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.73 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  34.18 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  36.11 
 
 		 361 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  31.91 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.68 
 
 		 400 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 		 332 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  29.07 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6518  hypothetical protein  35.8 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.71 
 
 		 291 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  32.35 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4183  hypothetical protein  37.66 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0842  hypothetical protein  24.07 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.62 
 
 		 291 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  28.77 
 
 		 610 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  31.82 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1664  hypothetical protein  31.25 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.516137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1485  flagellar protein FlgJ  30.3 
 
 		 379 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.477202  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  27.14 
 
 		 388 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  32.35 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3575  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.68 
 
 		 328 aa  42  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1466  flagellar biosynthesis  34.85 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.84 
 
 		 294 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0776  hypothetical protein  34.48 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  33.33 
 
 		 238 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  30.88 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2956  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.34 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  33.33 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  27.72 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.49 
 
 		 353 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1711  flagellar protein FlgJ  32.05 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243239  normal  0.214727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1329  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.5 
 
 		 350 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6093  hypothetical protein  32.05 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0671984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.11 
 
 		 394 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>