148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3046 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  59.62 
 
 
121 aa  123  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  52.58 
 
 
123 aa  106  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  62.35 
 
 
120 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  60.71 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  67.69 
 
 
120 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  50.51 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.93 
 
 
353 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  41.98 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  42.47 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0512  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.53 
 
 
328 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0901  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  45.12 
 
 
371 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337288  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  43.08 
 
 
119 aa  62  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  35.24 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  39.76 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  41.46 
 
 
316 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.08 
 
 
317 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.650654  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1784  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  45.71 
 
 
312 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3096  hypothetical protein  45.35 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  35.42 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  40.91 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2726  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.96 
 
 
348 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000204144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  40.91 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1329  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  43.53 
 
 
350 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1267  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.37 
 
 
384 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1337  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.37 
 
 
384 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.75524  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2047  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.5 
 
 
313 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.277131  normal  0.106816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01077  flagellar biosynthesis protein FlgJ  36.19 
 
 
313 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2565  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.19 
 
 
313 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01085  hypothetical protein  36.19 
 
 
313 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01295  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.53 
 
 
308 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.19 
 
 
313 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0662676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.19 
 
 
313 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.592055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2519  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.19 
 
 
313 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004165  flagellar protein FlgJ  39.77 
 
 
307 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.63 
 
 
380 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2939  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.63 
 
 
380 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3241  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.71 
 
 
384 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1311  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.56 
 
 
367 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1424  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.63 
 
 
380 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3433  putative chemotactic signal-response protein CheL  41.94 
 
 
108 aa  57  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2954  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.63 
 
 
380 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  37.31 
 
 
105 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.28 
 
 
291 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  34.34 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1460  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.27 
 
 
313 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.969398  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2622  hypothetical protein  42.42 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00105053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1605  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.48 
 
 
336 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202328  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1294  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.04 
 
 
316 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  hitchhiker  0.00280801 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1329  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.41 
 
 
389 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0311212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2589  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.41 
 
 
385 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3079  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
337 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1348  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40 
 
 
363 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1353  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.29 
 
 
341 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2190  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.04 
 
 
316 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367397 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2003  flagellar protein FlgJ  43.33 
 
 
560 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.04 
 
 
316 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00375392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1595  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.56 
 
 
317 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1250  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.04 
 
 
316 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.379236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1279  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.04 
 
 
316 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.814453  hitchhiker  0.00560108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1169  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.48 
 
 
377 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0546909  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.79 
 
 
291 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1485  flagellar protein FlgJ  37.04 
 
 
379 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.477202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2310  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32 
 
 
372 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  40.91 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  35.8 
 
 
388 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  47.06 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  30.69 
 
 
318 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16530  hypothetical protein  40.91 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000232005  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0761  hypothetical protein  40.51 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1970  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  39.39 
 
 
370 aa  50.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1898  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  44.62 
 
 
399 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1533  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.1 
 
 
325 aa  50.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.58 
 
 
361 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.58 
 
 
361 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  39.13 
 
 
361 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0757  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  38.1 
 
 
324 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0248  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.25 
 
 
310 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  40 
 
 
605 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0842  hypothetical protein  33.7 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1263  rod binding-like protein  36.49 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.346021  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  42.65 
 
 
294 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06162  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40 
 
 
392 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01004  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40 
 
 
392 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135593  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3363  putative flagellar protein FlgJ  37.97 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5633  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.42 
 
 
348 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4191  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.42 
 
 
327 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2590  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.62 
 
 
320 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1876  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.95 
 
 
320 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.803787  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  34.94 
 
 
610 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1962  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  36.56 
 
 
290 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  32.58 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3099  hypothetical protein  37.88 
 
 
129 aa  47.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0934  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40 
 
 
351 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  31.33 
 
 
116 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3742  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.24 
 
 
340 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.412166  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  32.35 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1664  hypothetical protein  39.71 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.516137  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3575  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.02 
 
 
328 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2956  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.27 
 
 
310 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4659 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>