57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2555 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  224  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  38.61 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3433  putative chemotactic signal-response protein CheL  44.05 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  41.18 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  43.66 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  45.33 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  39.78 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  42.47 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  38.96 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  39.02 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  41.89 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  45 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  42.03 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  41.56 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  40 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  31.43 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  31.43 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  36.99 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  43.48 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  38.03 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  35.8 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  40.91 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2976  flagellar protein FlgJ, putative  32.99 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  40.58 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  36.99 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  34.85 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  31.17 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  27.85 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  29.41 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1008  flagellar protein, putative  31.58 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.59 
 
 		 291 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  26.04 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.59 
 
 		 291 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  35.53 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2336  hypothetical protein  26.74 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3363  putative flagellar protein FlgJ  27.72 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1334  chemotactic signal-response protein CheL  37.66 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.406333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.14 
 
 		 332 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0003  putative chemotactic signal-response protein CheL  37.66 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0761  hypothetical protein  31.65 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  31.51 
 
 		 388 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  29.36 
 
 		 318 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.93 
 
 		 430 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  30.34 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  35.71 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0842  hypothetical protein  26.19 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0901  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.57 
 
 		 371 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2956  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.38 
 
 		 310 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4659 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.86 
 
 		 353 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  34.21 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2622  hypothetical protein  22.97 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00105053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  35.94 
 
 		 178 aa  40  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1595  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.95 
 
 		 317 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3575  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.72 
 
 		 328 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  38.46 
 
 		 158 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.091579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>