73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3277 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  100 
 
 
128 aa  257  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  52.29 
 
 
121 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  52.63 
 
 
123 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  50.51 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  50.62 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  55.07 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  52.94 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  42.19 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0512  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40 
 
 
328 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0901  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.24 
 
 
371 aa  57.8  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337288  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  37.8 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  47.46 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  41.67 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.23 
 
 
353 aa  54.7  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  47.37 
 
 
197 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  38.36 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3099  hypothetical protein  37.5 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3096  hypothetical protein  36.96 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16530  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000232005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  31.18 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  35.44 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  38.24 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2962  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.57 
 
 
318 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0248  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.21 
 
 
310 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  35.53 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2622  hypothetical protein  34.92 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00105053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1970  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.33 
 
 
370 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3062  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.47 
 
 
330 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6093  hypothetical protein  35.8 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0671984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4191  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.47 
 
 
327 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1711  flagellar protein FlgJ  35.8 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243239  normal  0.214727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1329  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.66 
 
 
350 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2003  flagellar protein FlgJ  31.4 
 
 
560 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1664  hypothetical protein  38.24 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.516137  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004165  flagellar protein FlgJ  36 
 
 
307 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0842  hypothetical protein  40.98 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  34.72 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  35.62 
 
 
388 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.78 
 
 
430 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  34.72 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01295  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.84 
 
 
308 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1263  rod binding-like protein  36.59 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.346021  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1533  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.72 
 
 
325 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2927  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.14 
 
 
330 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3333  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.5 
 
 
311 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  36.67 
 
 
318 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  40.74 
 
 
109 aa  42  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  34.62 
 
 
114 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0471  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.5 
 
 
311 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2417  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.39 
 
 
314 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3002  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.5 
 
 
311 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2091  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.5 
 
 
311 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.39 
 
 
314 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0274  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.5 
 
 
311 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.659394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0286  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.5 
 
 
311 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3346  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.5 
 
 
311 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2316  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.39 
 
 
314 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0757  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.21 
 
 
324 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  33.33 
 
 
361 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3012  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.68 
 
 
319 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.67 
 
 
317 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.650654  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.67 
 
 
294 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0598  Flagellar protein FlgJ-like protein  35.71 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1962  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.33 
 
 
290 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  34.29 
 
 
605 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.09 
 
 
332 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2403  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.14 
 
 
330 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2956  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.55 
 
 
310 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2726  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.11 
 
 
348 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000204144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3017  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.14 
 
 
330 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3036  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.14 
 
 
327 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6363  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.14 
 
 
327 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>