179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5633 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5633  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  100 
 
 
348 aa  700    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3742  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  72.89 
 
 
340 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.412166  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6363  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  48.31 
 
 
327 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.68 
 
 
361 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.68 
 
 
361 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0248  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  45.56 
 
 
310 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  43.99 
 
 
361 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2956  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  45.53 
 
 
310 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4659 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1329  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  46.18 
 
 
350 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  46.97 
 
 
332 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2927  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  47.74 
 
 
330 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3062  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  48.56 
 
 
330 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3333  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  48.22 
 
 
311 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0471  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  48.22 
 
 
311 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3002  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  48.22 
 
 
311 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2091  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  48.22 
 
 
311 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0286  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  48.22 
 
 
311 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3346  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  48.22 
 
 
311 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0274  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  48.22 
 
 
311 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.659394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2316  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  44.78 
 
 
314 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2417  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  44.78 
 
 
314 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  44.18 
 
 
314 aa  259  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2962  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  44.14 
 
 
318 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24080  flagellar rod assembly protein/muramidase  47.06 
 
 
325 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3036  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.97 
 
 
327 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0148  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  45.4 
 
 
332 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2047  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.76 
 
 
313 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.277131  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1533  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.76 
 
 
325 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2590  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.71 
 
 
320 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1962  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  41.35 
 
 
290 aa  237  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1876  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.41 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.803787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01077  flagellar biosynthesis protein FlgJ  40.91 
 
 
313 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2565  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.91 
 
 
313 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2519  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.91 
 
 
313 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.91 
 
 
313 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.592055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01085  hypothetical protein  40.91 
 
 
313 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.91 
 
 
313 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0662676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1460  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.74 
 
 
313 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.969398  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.52 
 
 
316 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00375392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1279  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.35 
 
 
316 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.814453  hitchhiker  0.00560108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2190  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.35 
 
 
316 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367397 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1294  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.23 
 
 
316 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  hitchhiker  0.00280801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2403  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.23 
 
 
330 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3017  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.23 
 
 
330 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1250  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.94 
 
 
316 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.379236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4191  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  66.89 
 
 
327 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2916  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.33 
 
 
352 aa  202  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3109  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.46 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3065  flagellum-specific muramidase  40.12 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  0.342418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3836  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.39 
 
 
324 aa  199  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0625  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.81 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  61.18 
 
 
294 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3722  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  39.6 
 
 
308 aa  185  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.3 
 
 
353 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1485  flagellar protein FlgJ  32.09 
 
 
379 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.477202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  34.33 
 
 
316 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3012  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  60 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004165  flagellar protein FlgJ  34.02 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  56.69 
 
 
317 aa  173  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.650654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1110  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.61 
 
 
328 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1784  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.45 
 
 
312 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1970  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  53.06 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01295  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  58.39 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0934  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.18 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0757  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  52 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4382  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.62 
 
 
384 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1311  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.15 
 
 
367 aa  162  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1605  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.2 
 
 
336 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202328  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3943  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.62 
 
 
384 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1473  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.43 
 
 
384 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1225  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.26 
 
 
323 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.633335  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3079  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.25 
 
 
337 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.25 
 
 
394 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2330  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
332 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4429  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  54.01 
 
 
300 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  30.16 
 
 
318 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3723  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.71 
 
 
388 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1595  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  51.03 
 
 
317 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.94 
 
 
400 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1348  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  28.34 
 
 
363 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1169  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.42 
 
 
377 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0546909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1353  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.78 
 
 
341 aa  149  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.74 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.69 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1267  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.74 
 
 
384 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0901  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.19 
 
 
371 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337288  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3241  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.02 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1424  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.47 
 
 
380 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1337  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.79 
 
 
384 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.75524  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2726  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  53.52 
 
 
348 aa  146  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000204144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2954  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.47 
 
 
380 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1329  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.91 
 
 
389 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0311212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2939  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  28.84 
 
 
380 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.11 
 
 
269 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2589  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  28.08 
 
 
385 aa  142  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2370  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.11 
 
 
325 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0182  flagellar protein FlgJ  53.52 
 
 
264 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0236  flagellar protein FlgJ  49.68 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1898  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  53.38 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>