184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3723 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4382  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  82.47 
 
 
384 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3943  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  83.76 
 
 
384 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3723  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  100 
 
 
388 aa  790    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1473  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  88.66 
 
 
384 aa  707    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3472  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  62.23 
 
 
414 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.603408  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1943  peptidoglycan hydrolase FlgJ  60.1 
 
 
416 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0130803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  59.62 
 
 
430 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  56.97 
 
 
400 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  56.72 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  56.36 
 
 
394 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1110  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.03 
 
 
328 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1311  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.64 
 
 
367 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1348  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.62 
 
 
363 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.48 
 
 
380 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1424  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.22 
 
 
380 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1605  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.25 
 
 
336 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202328  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2954  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.22 
 
 
380 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2939  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.22 
 
 
380 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1337  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.99 
 
 
384 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.75524  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1267  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.1 
 
 
384 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2589  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.84 
 
 
385 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3241  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.46 
 
 
384 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1329  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.62 
 
 
389 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0311212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1169  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.46 
 
 
377 aa  202  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0546909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  35.9 
 
 
316 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1353  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.29 
 
 
341 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3079  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.34 
 
 
337 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3575  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.06 
 
 
328 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1485  flagellar protein FlgJ  33.88 
 
 
379 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.477202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.85 
 
 
269 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2330  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.12 
 
 
332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.51 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6363  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.38 
 
 
327 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0934  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.71 
 
 
351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0901  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.57 
 
 
371 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337288  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2316  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
314 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2417  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
314 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0248  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.84 
 
 
310 aa  169  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.06 
 
 
314 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1533  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.88 
 
 
325 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3333  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.43 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0471  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.43 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3002  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.43 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2091  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.43 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0274  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.43 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.659394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0286  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.43 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3346  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.43 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1898  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.47 
 
 
399 aa  166  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2916  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.13 
 
 
352 aa  166  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2962  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.79 
 
 
318 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.82 
 
 
361 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004165  flagellar protein FlgJ  45.81 
 
 
307 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.82 
 
 
361 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  33.78 
 
 
361 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01295  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.93 
 
 
308 aa  159  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1784  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.64 
 
 
312 aa  159  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2370  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.45 
 
 
325 aa  157  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2956  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.47 
 
 
310 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2310  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  45.96 
 
 
372 aa  156  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1329  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.25 
 
 
350 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  53.52 
 
 
291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3742  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.87 
 
 
340 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.412166  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06162  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  54.17 
 
 
392 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01004  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  54.17 
 
 
392 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135593  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  47.68 
 
 
294 aa  150  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  52.82 
 
 
291 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  46.1 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3012  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  46.2 
 
 
319 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2927  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  45.57 
 
 
330 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3062  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  45.57 
 
 
330 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2726  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.55 
 
 
348 aa  145  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000204144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0148  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.04 
 
 
332 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4669  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  39.66 
 
 
253 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3036  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  44.3 
 
 
327 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.41 
 
 
332 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2403  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  44.3 
 
 
330 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3017  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  44.3 
 
 
330 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0625  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  48.23 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0757  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  43.21 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1962  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  39.33 
 
 
290 aa  139  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4429  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  48.23 
 
 
300 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01077  flagellar biosynthesis protein FlgJ  46.67 
 
 
313 aa  136  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2565  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  46.67 
 
 
313 aa  136  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2519  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  46.67 
 
 
313 aa  136  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  46.67 
 
 
313 aa  136  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0662676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01085  hypothetical protein  46.67 
 
 
313 aa  136  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  46.67 
 
 
313 aa  136  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.592055  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24080  flagellar rod assembly protein/muramidase  33.88 
 
 
325 aa  136  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1460  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  46.67 
 
 
313 aa  135  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.969398  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2047  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  46.67 
 
 
313 aa  135  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.277131  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1225  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  46.48 
 
 
323 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.633335  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0512  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  50 
 
 
328 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3836  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  44.68 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3109  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  44.68 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1970  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  43.84 
 
 
370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3065  flagellum-specific muramidase  43.57 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  0.342418 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5633  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  44.65 
 
 
348 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3722  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  44.6 
 
 
308 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0182  flagellar protein FlgJ  42.36 
 
 
264 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0236  flagellar protein FlgJ  40.4 
 
 
264 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>