44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1953 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  214  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  39.78 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  41.03 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  38.96 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  38.16 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  35.53 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  35.53 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  37.66 
 
 
118 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  37.66 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  36.49 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  35.14 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  36.11 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  34.34 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  36.49 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  35.53 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  36.11 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  36.11 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  44.78 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  37.88 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3433  putative chemotactic signal-response protein CheL  35.23 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  31.88 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  32.89 
 
 
113 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2976  flagellar protein FlgJ, putative  43.66 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  35.53 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  32.43 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  35.82 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  28.95 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  25 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0761  hypothetical protein  38.33 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  39.68 
 
 
193 aa  45.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0003  putative chemotactic signal-response protein CheL  37.18 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1334  chemotactic signal-response protein CheL  37.18 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.406333  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  35.62 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  33.33 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3363  putative flagellar protein FlgJ  45 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  32.31 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2622  hypothetical protein  31.08 
 
 
116 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00105053  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  26.83 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2597  hypothetical protein  38.1 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  hitchhiker  0.000125377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  29.21 
 
 
187 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  33.8 
 
 
388 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  28.99 
 
 
361 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2916  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.36 
 
 
352 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  35.82 
 
 
605 aa  40  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>