49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1496 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  100 
 
 		 115 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  71.03 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  70.87 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  70.3 
 
 		 111 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  68.32 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  68.93 
 
 		 113 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  75.56 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  38.75 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  41.56 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  41.56 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  37.97 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  41.89 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  37.8 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  36.99 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  37.5 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  32.86 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2336  hypothetical protein  32.05 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  25.93 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  28.95 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  29.79 
 
 		 605 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  25.33 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.99 
 
 		 400 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  31.94 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  30.43 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.99 
 
 		 400 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  24.29 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  30.14 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  28.57 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  30.11 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3575  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 		 328 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  28.77 
 
 		 610 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  27.16 
 
 		 388 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  29.58 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  33.8 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  29.58 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  38.57 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  26.51 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3096  hypothetical protein  29.29 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.94 
 
 		 332 aa  42  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  29.58 
 
 		 187 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  33.33 
 
 		 361 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36 
 
 		 361 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36 
 
 		 361 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  29.41 
 
 		 243 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  32.32 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0003  putative chemotactic signal-response protein CheL  30 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1334  chemotactic signal-response protein CheL  30 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.406333  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.38 
 
 		 394 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>