19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0003 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0003  putative chemotactic signal-response protein CheL  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1334  chemotactic signal-response protein CheL  98.91 
 
 		 92 aa  183  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.406333  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2597  hypothetical protein  69.57 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  hitchhiker  0.000125377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  50.67 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2976  flagellar protein FlgJ, putative  50.55 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3363  putative flagellar protein FlgJ  46.43 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  29.29 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  30.1 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  37.66 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  33.33 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  37.18 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  36.11 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  33.96 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  30 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  33.01 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  28.26 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  31.51 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0761  hypothetical protein  32.93 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>