44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1343 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  100 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  75.61 
 
 		 129 aa  190  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  70.87 
 
 		 115 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  69.7 
 
 		 114 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  72.63 
 
 		 113 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  68.37 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  63.16 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  41.18 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  42.47 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  37.5 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  30.88 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  28.24 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  30.26 
 
 		 605 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2336  hypothetical protein  26.09 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2622  hypothetical protein  27.06 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00105053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.78 
 
 		 400 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.78 
 
 		 400 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  27.38 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  30.95 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  30.14 
 
 		 610 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.44 
 
 		 361 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.44 
 
 		 361 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3575  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.94 
 
 		 328 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  30 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  28.21 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  28.28 
 
 		 120 aa  43.5  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  24.64 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  32.47 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  35.94 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.48 
 
 		 332 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  35.94 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.37 
 
 		 394 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  34.18 
 
 		 361 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  33.87 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2976  flagellar protein FlgJ, putative  28.99 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  35 
 
 		 158 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.091579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>