25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2976 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2976  flagellar protein FlgJ, putative  100 
 
 		 96 aa  189  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3363  putative flagellar protein FlgJ  53.33 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2597  hypothetical protein  53.25 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  hitchhiker  0.000125377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  46.74 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1334  chemotactic signal-response protein CheL  50.55 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.406333  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0003  putative chemotactic signal-response protein CheL  50.55 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  40 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  32.99 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  31.25 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  43.66 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3433  putative chemotactic signal-response protein CheL  34.88 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  37.8 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  35.44 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  36.76 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  39.73 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  37.04 
 
 		 114 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  43.94 
 
 		 243 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  43.48 
 
 		 238 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  34.62 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  43.48 
 
 		 238 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  33.8 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  28.99 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  30.3 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  32.26 
 
 		 120 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  30.14 
 
 		 109 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>