144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1152 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  100 
 
 
108 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0598  Flagellar protein FlgJ-like protein  40 
 
 
109 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  33.04 
 
 
605 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  39.73 
 
 
388 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  37.66 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  40 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2003  flagellar protein FlgJ  39.71 
 
 
560 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2622  hypothetical protein  38.24 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00105053  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  38.36 
 
 
610 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  43.24 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  38.37 
 
 
318 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  43.84 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3096  hypothetical protein  31.58 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2336  hypothetical protein  36.76 
 
 
116 aa  60.1  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  39.73 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  33.8 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2956  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.5 
 
 
310 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  40.91 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0248  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.89 
 
 
310 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0901  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.64 
 
 
371 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337288  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  41.43 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0512  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.55 
 
 
328 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.34 
 
 
317 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.650654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  41.67 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1110  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.75 
 
 
328 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.81 
 
 
332 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5633  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.68 
 
 
348 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3742  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.99 
 
 
340 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.412166  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1595  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.25 
 
 
317 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  28.57 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  29.59 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4191  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.25 
 
 
327 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2916  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.51 
 
 
352 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1876  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.93 
 
 
320 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.803787  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  31.17 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  36.36 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2590  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
320 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  33.33 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1460  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.969398  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01077  flagellar biosynthesis protein FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2565  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112563  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3643  peptidoglycan hydrolase  40.79 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01085  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3062  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.33 
 
 
330 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.58 
 
 
353 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1664  hypothetical protein  35.53 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.516137  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  39.06 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0662676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.592055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2519  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2047  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
313 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.277131  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2927  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.33 
 
 
330 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.78 
 
 
316 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00375392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16530  hypothetical protein  34.09 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000232005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2190  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.78 
 
 
316 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6363  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.33 
 
 
327 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1294  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.78 
 
 
316 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  hitchhiker  0.00280801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2403  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.33 
 
 
330 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3017  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.33 
 
 
330 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1250  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.78 
 
 
316 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.379236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1279  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.78 
 
 
316 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.814453  hitchhiker  0.00560108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3036  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.33 
 
 
327 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2962  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.78 
 
 
318 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3012  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.67 
 
 
319 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1533  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.25 
 
 
325 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.21 
 
 
394 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3099  hypothetical protein  27.63 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  32.5 
 
 
361 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  25.93 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1962  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.46 
 
 
290 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4429  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.86 
 
 
300 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2316  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.86 
 
 
314 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.86 
 
 
314 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2417  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.86 
 
 
314 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112491  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0271  lateral flagellar peptidoglycan hydrolase LfgJ  35.37 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.697145 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  26.32 
 
 
294 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.21 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35 
 
 
400 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35 
 
 
400 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  26.04 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3363  rod binding protein-like protein  34.15 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.21 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0757  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.08 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  34.38 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1225  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.6 
 
 
323 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.633335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  29.41 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  25.97 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.58 
 
 
430 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  29.52 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3460  peptidoglycan hydrolase  35.53 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0842  hypothetical protein  27.27 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0061  peptidoglycan hydrolase  40.79 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24080  flagellar rod assembly protein/muramidase  34.21 
 
 
325 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3963  peptidoglycan hydrolase  35.53 
 
 
135 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6093  hypothetical protein  34.25 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0671984  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1329  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.82 
 
 
350 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1711  flagellar protein FlgJ  34.25 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243239  normal  0.214727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  36.59 
 
 
316 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.39 
 
 
311 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0934  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.46 
 
 
351 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>