141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3758 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  100 
 
 
120 aa  241  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  87.5 
 
 
118 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  53.15 
 
 
120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  62.35 
 
 
126 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  69.57 
 
 
121 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  55.7 
 
 
123 aa  93.6  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  55.07 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.24 
 
 
353 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  43.48 
 
 
109 aa  60.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  33.75 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  39.73 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1595  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.3 
 
 
317 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2047  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.95 
 
 
313 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.277131  normal  0.106816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01077  flagellar biosynthesis protein FlgJ  38.95 
 
 
313 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2565  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.95 
 
 
313 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0901  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  44.93 
 
 
371 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337288  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01085  hypothetical protein  38.95 
 
 
313 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.95 
 
 
313 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0662676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.95 
 
 
313 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.592055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2519  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.95 
 
 
313 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3096  hypothetical protein  42.47 
 
 
158 aa  57.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1250  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.38 
 
 
316 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.379236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1279  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.38 
 
 
316 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.814453  hitchhiker  0.00560108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.38 
 
 
316 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00375392  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  37.66 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2190  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.38 
 
 
316 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0512  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.67 
 
 
328 aa  57.8  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1294  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.04 
 
 
316 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  hitchhiker  0.00280801 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  34.29 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  38.57 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.78 
 
 
294 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1329  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  36.36 
 
 
350 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2003  flagellar protein FlgJ  40.96 
 
 
560 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1460  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.08 
 
 
313 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.969398  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2622  hypothetical protein  35.14 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00105053  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3363  putative flagellar protein FlgJ  47.76 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1898  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.44 
 
 
399 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06162  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.16 
 
 
392 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01004  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.16 
 
 
392 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135593  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
317 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.650654  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  36.62 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01295  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.68 
 
 
308 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16530  hypothetical protein  36.25 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000232005  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3723  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.84 
 
 
388 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4191  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40 
 
 
327 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.27 
 
 
400 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  36.62 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1962  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  40.28 
 
 
290 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  35.21 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1943  peptidoglycan hydrolase FlgJ  39.02 
 
 
416 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0130803  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.71 
 
 
291 aa  52  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3472  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.56 
 
 
414 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.603408  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.11 
 
 
394 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1473  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.56 
 
 
384 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.04 
 
 
400 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  36.11 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2726  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  42.03 
 
 
348 aa  52  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000204144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004165  flagellar protein FlgJ  31.58 
 
 
307 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5633  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
348 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  33.33 
 
 
316 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1533  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.07 
 
 
325 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.57 
 
 
291 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  40 
 
 
318 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0761  hypothetical protein  37.65 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  36.62 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  33 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3943  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.41 
 
 
384 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  33.33 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.59 
 
 
430 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1784  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.8 
 
 
312 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4382  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.41 
 
 
384 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3099  hypothetical protein  32.58 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2916  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.62 
 
 
352 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  35.48 
 
 
605 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24080  flagellar rod assembly protein/muramidase  35.71 
 
 
325 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  37.35 
 
 
197 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2316  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.56 
 
 
314 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.56 
 
 
314 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2417  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.56 
 
 
314 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0757  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  36.62 
 
 
324 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0248  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40 
 
 
310 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3742  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
340 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.412166  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  35.29 
 
 
388 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3575  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.77 
 
 
328 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  33.33 
 
 
361 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0934  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.1 
 
 
351 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1664  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.516137  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  37.68 
 
 
119 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1110  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.77 
 
 
328 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197589  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0598  Flagellar protein FlgJ-like protein  34.78 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1263  rod binding-like protein  35.29 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.346021  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  34.78 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  37.5 
 
 
610 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2590  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.23 
 
 
320 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2962  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.8 
 
 
318 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3722  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.48 
 
 
308 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.439201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  31.94 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2091  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.57 
 
 
311 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0286  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.57 
 
 
311 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>