39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4205 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  100 
 
 
100 aa  199  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2976  flagellar protein FlgJ, putative  46.74 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3363  putative flagellar protein FlgJ  54.41 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1334  chemotactic signal-response protein CheL  50.67 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.406333  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0003  putative chemotactic signal-response protein CheL  50.67 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2597  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  hitchhiker  0.000125377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  41.56 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  36.11 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  47.06 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  32.47 
 
 
111 aa  52  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  42.22 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  36.11 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  31.25 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  33 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  45.07 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  32.86 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  34.21 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  35.44 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  33.33 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  32.56 
 
 
123 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  32.91 
 
 
116 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  30.63 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  29.9 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  31.11 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  28.57 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  30 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  31.58 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.73 
 
 
400 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.57 
 
 
400 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  31.08 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3433  putative chemotactic signal-response protein CheL  38.78 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  28.57 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3575  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25 
 
 
328 aa  40.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.33 
 
 
291 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.33 
 
 
291 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  32.43 
 
 
108 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  30.88 
 
 
109 aa  40  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>