49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1110 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  100 
 
 		 129 aa  267  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  75.61 
 
 		 131 aa  190  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  68.32 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  66.35 
 
 		 114 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  70.3 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  71.13 
 
 		 111 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  69.89 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  40.91 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  40.91 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  42.68 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  43.66 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  43.04 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  43.24 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  45.21 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  37.66 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  37.5 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  29.41 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.28 
 
 		 400 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  29.21 
 
 		 605 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  26.83 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  28.33 
 
 		 400 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  30.14 
 
 		 610 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2336  hypothetical protein  23.17 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  34.57 
 
 		 193 aa  45.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  26.09 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  29.41 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2622  hypothetical protein  25.88 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00105053  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1664  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.516137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  37.1 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3472  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25.42 
 
 		 414 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.603408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  25.64 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6093  hypothetical protein  33.78 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0671984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  30.14 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  25.61 
 
 		 388 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  30.43 
 
 		 120 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1711  flagellar protein FlgJ  33.78 
 
 		 100 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243239  normal  0.214727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  34.38 
 
 		 156 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  35.94 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  35.94 
 
 		 160 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  28.57 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  30.14 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0842  hypothetical protein  28.79 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2976  flagellar protein FlgJ, putative  30.3 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0003  putative chemotactic signal-response protein CheL  28.26 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1334  chemotactic signal-response protein CheL  28.26 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.406333  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.43 
 
 		 361 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.43 
 
 		 361 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>