151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0435 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  100 
 
 
121 aa  242  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  59.62 
 
 
126 aa  123  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  76.47 
 
 
120 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  65.17 
 
 
118 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  52.29 
 
 
128 aa  100  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  69.57 
 
 
120 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  56 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1768  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  45.57 
 
 
353 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.917503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  44.16 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  45 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  36.67 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  43.21 
 
 
361 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  43.24 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3096  hypothetical protein  37.62 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40 
 
 
430 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.78 
 
 
400 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.61 
 
 
400 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1460  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.46 
 
 
313 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.969398  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  38.38 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.98 
 
 
361 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.98 
 
 
361 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.186683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01077  flagellar biosynthesis protein FlgJ  38.46 
 
 
313 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.141706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2565  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.46 
 
 
313 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112563  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  46.75 
 
 
291 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  45.59 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.46 
 
 
313 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0662676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1204  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.46 
 
 
313 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.592055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01085  hypothetical protein  38.46 
 
 
313 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.188745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2519  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.46 
 
 
313 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0901  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.58 
 
 
371 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337288  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2726  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  45 
 
 
348 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000204144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  46.84 
 
 
291 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  41.33 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  33.68 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0512  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.66 
 
 
328 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1595  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  46.05 
 
 
317 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3241  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.46 
 
 
384 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2047  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.5 
 
 
313 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.277131  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1943  peptidoglycan hydrolase FlgJ  37.5 
 
 
416 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0130803  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1329  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  45.71 
 
 
350 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  41.57 
 
 
605 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4429  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.47 
 
 
300 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3472  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.36 
 
 
414 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.603408  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0757  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.56 
 
 
324 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2190  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.38 
 
 
316 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367397 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1294  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.5 
 
 
316 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  hitchhiker  0.00280801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1533  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  43.37 
 
 
325 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1250  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.38 
 
 
316 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.379236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  36.49 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1279  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.38 
 
 
316 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.814453  hitchhiker  0.00560108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.38 
 
 
316 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00375392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  40.91 
 
 
388 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.36 
 
 
317 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.650654  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1348  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.29 
 
 
363 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2590  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
320 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0248  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.86 
 
 
310 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3062  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.24 
 
 
330 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  36.23 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2403  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.86 
 
 
330 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3017  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.86 
 
 
330 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3036  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.86 
 
 
327 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1337  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.24 
 
 
384 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.75524  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3099  hypothetical protein  33.65 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  43.84 
 
 
197 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6363  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.86 
 
 
327 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1267  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.24 
 
 
384 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  40 
 
 
610 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2939  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.58 
 
 
380 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1353  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.96 
 
 
341 aa  52.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2954  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.58 
 
 
380 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004165  flagellar protein FlgJ  40.28 
 
 
307 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3079  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.38 
 
 
337 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.58 
 
 
380 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1424  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.58 
 
 
380 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2927  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.3 
 
 
330 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1876  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
320 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.803787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.97 
 
 
294 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2003  flagellar protein FlgJ  40 
 
 
560 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.39 
 
 
394 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16530  hypothetical protein  35.05 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000232005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1605  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.02 
 
 
336 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202328  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1311  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
367 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1169  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.02 
 
 
377 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0546909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  36.78 
 
 
316 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3012  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  39.13 
 
 
319 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1962  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.5 
 
 
290 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2589  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 
385 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3333  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.45 
 
 
311 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0471  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.45 
 
 
311 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3742  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.33 
 
 
340 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.412166  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3002  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.45 
 
 
311 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2091  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.45 
 
 
311 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0274  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.45 
 
 
311 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.659394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0286  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.45 
 
 
311 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3346  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.45 
 
 
311 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1473  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.53 
 
 
384 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2962  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.79 
 
 
318 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  34.57 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4191  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.76 
 
 
327 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  45.07 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>