31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3042 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  89.08 
 
 		 119 aa  203  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  55.56 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  53.85 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  66.67 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  40.91 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  43.42 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  40.21 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  43.42 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  40 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  41.56 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  31.43 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  38.03 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  35.53 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  39.13 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  34 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  31.3 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  28.7 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0776  hypothetical protein  31.53 
 
 		 210 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  33.8 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  31.51 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  33.8 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  32.39 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  31.08 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  28.57 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  27.5 
 
 		 108 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3433  putative chemotactic signal-response protein CheL  28.38 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  32.39 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  31.34 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6518  hypothetical protein  30.68 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>