23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0693 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  314  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  99.29 
 
 		 160 aa  254  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  87.82 
 
 		 156 aa  246  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6518  hypothetical protein  62.42 
 
 		 153 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  54.05 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0776  hypothetical protein  45.83 
 
 		 210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  45.14 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  46.43 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  45.77 
 
 		 187 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1121  hypothetical protein  41.56 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1034  hypothetical protein  38.67 
 
 		 210 aa  92.8  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1129  hypothetical protein  38.67 
 
 		 196 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  37.01 
 
 		 193 aa  90.9  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4183  hypothetical protein  39.16 
 
 		 205 aa  90.5  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  35.29 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3587  hypothetical protein  36.43 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0052  hypothetical protein  37.93 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  34.62 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  38.18 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  35.94 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  36.23 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  38.18 
 
 		 111 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  35.94 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>