30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0380 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  94.65 
 
 		 187 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  63.07 
 
 		 183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0776  hypothetical protein  45.99 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6518  hypothetical protein  43.17 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  40.52 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1121  hypothetical protein  41.83 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1034  hypothetical protein  41.22 
 
 		 210 aa  101  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1129  hypothetical protein  41.22 
 
 		 196 aa  101  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  43.88 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4183  hypothetical protein  42 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  42.96 
 
 		 158 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  42.25 
 
 		 156 aa  99  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  42.25 
 
 		 160 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  36.17 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3587  hypothetical protein  37.24 
 
 		 169 aa  84.3  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0052  hypothetical protein  32.87 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  31.3 
 
 		 119 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  31.3 
 
 		 119 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  31 
 
 		 109 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  29.57 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.11 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  35.71 
 
 		 109 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  28.75 
 
 		 108 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  29.21 
 
 		 108 aa  42  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  29.58 
 
 		 115 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  27.27 
 
 		 111 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  29.11 
 
 		 114 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  28.17 
 
 		 291 aa  41.2  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>