26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0667 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  314  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  87.82 
 
 
156 aa  243  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  90.71 
 
 
160 aa  239  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6518  hypothetical protein  64.47 
 
 
153 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  54.73 
 
 
158 aa  140  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0776  hypothetical protein  45.14 
 
 
210 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  46.43 
 
 
183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  45.71 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  42.36 
 
 
187 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1121  hypothetical protein  44.67 
 
 
160 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4183  hypothetical protein  40.28 
 
 
205 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1034  hypothetical protein  42.76 
 
 
210 aa  93.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1129  hypothetical protein  42.76 
 
 
196 aa  93.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  37.33 
 
 
193 aa  89.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0052  hypothetical protein  37.93 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3587  hypothetical protein  36.88 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  31.21 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  35.9 
 
 
113 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  36.67 
 
 
109 aa  47.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  38.46 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  33.8 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  33.8 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  36.36 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  34.38 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  31.76 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1456  hypothetical protein  25.81 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>