22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6518 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6518  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  64.83 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  61.54 
 
 
160 aa  158  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  61.54 
 
 
156 aa  158  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  56.08 
 
 
158 aa  147  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  44.03 
 
 
183 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0776  hypothetical protein  41.84 
 
 
210 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1129  hypothetical protein  45.39 
 
 
196 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1034  hypothetical protein  45.39 
 
 
210 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  43.17 
 
 
187 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  39.72 
 
 
187 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4183  hypothetical protein  44.97 
 
 
205 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1121  hypothetical protein  38.41 
 
 
160 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  35.9 
 
 
193 aa  95.1  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3587  hypothetical protein  38.19 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0052  hypothetical protein  41.13 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  35.8 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  35.14 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  30.68 
 
 
119 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  30.68 
 
 
119 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  44.9 
 
 
111 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>