21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0269 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  348  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  33.68 
 
 
183 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  31.87 
 
 
187 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  36.17 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0776  hypothetical protein  35.66 
 
 
210 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  41.5 
 
 
158 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6518  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1034  hypothetical protein  28.93 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1129  hypothetical protein  29.74 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4183  hypothetical protein  28.42 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  32.61 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  32.61 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  30 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1121  hypothetical protein  30.41 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  29.58 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3587  hypothetical protein  31.62 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0052  hypothetical protein  31.88 
 
 
163 aa  58.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  32.35 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  35.24 
 
 
105 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  34.94 
 
 
113 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  36.84 
 
 
114 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0109399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>