22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0776 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0776  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  51.96 
 
 		 183 aa  175  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  47.59 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  45.99 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6518  hypothetical protein  41.84 
 
 		 153 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  45.83 
 
 		 156 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  45.14 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  45.14 
 
 		 160 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4183  hypothetical protein  42.66 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  39.04 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1121  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1034  hypothetical protein  42.14 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1129  hypothetical protein  40.51 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  35.66 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  37.25 
 
 		 193 aa  92.4  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3587  hypothetical protein  34.67 
 
 		 169 aa  84.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0052  hypothetical protein  32.34 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  31.53 
 
 		 119 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  31.53 
 
 		 119 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  38.18 
 
 		 109 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  28.57 
 
 		 108 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  34.48 
 
 		 113 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>