19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1121 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1121  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  317  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  42.59 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  41.14 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  40.52 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0776  hypothetical protein  40.69 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4183  hypothetical protein  41.61 
 
 		 205 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6518  hypothetical protein  38.41 
 
 		 153 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  39.61 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1034  hypothetical protein  41.61 
 
 		 210 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1129  hypothetical protein  41.61 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  44 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  40.14 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  39.74 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0052  hypothetical protein  35.4 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  33.77 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3587  hypothetical protein  33.11 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  30.41 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  36.99 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  33.33 
 
 		 108 aa  40.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>