30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0842 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0842  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  290  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0667  hypothetical protein  61.97 
 
 
88 aa  100  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.231371  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1201  hypothetical protein  45.83 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1254  hypothetical protein  45.83 
 
 
89 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  33.62 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0598  Flagellar protein FlgJ-like protein  28.04 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16530  hypothetical protein  29.67 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000232005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  29.06 
 
 
197 aa  50.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3096  hypothetical protein  32.67 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  30.23 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  33.7 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  27.27 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  32.32 
 
 
135 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2336  hypothetical protein  29.73 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3099  hypothetical protein  26.55 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2622  hypothetical protein  35.71 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00105053  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  24.07 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  26.73 
 
 
388 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  29 
 
 
318 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  31.08 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  40.98 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  26.19 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2003  flagellar protein FlgJ  29.76 
 
 
560 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2916  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  28 
 
 
352 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  40.82 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  29.07 
 
 
610 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  27.27 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  27.06 
 
 
605 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  35.21 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  28.79 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>