More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0649 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
282 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.174842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.81 
 
 
282 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.91 
 
 
282 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.46 
 
 
282 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.82 
 
 
280 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.82 
 
 
280 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0113  putative sugar ABC transporter (permease protein)  73.05 
 
 
282 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  66.08 
 
 
282 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.31 
 
 
282 aa  364  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342174  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.31 
 
 
283 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0857223  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1285  twin-arginine translocation pathway signal  63.25 
 
 
283 aa  359  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.48 
 
 
282 aa  359  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.48 
 
 
282 aa  359  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.12 
 
 
282 aa  359  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96596  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.06 
 
 
282 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.70012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.19 
 
 
283 aa  355  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.19 
 
 
282 aa  349  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0316  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.7 
 
 
281 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0325  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  61.7 
 
 
281 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2016  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein  62.77 
 
 
284 aa  349  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0189923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.84 
 
 
282 aa  348  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110391  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2710  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.64 
 
 
281 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0397  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.64 
 
 
281 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0258  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.64 
 
 
281 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3653  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.64 
 
 
281 aa  348  8e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.703589 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3960  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.64 
 
 
281 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.53735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0376  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.64 
 
 
281 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0236  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  59.57 
 
 
281 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.325941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0300  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.28 
 
 
281 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.99 
 
 
282 aa  345  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17735  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.54 
 
 
283 aa  345  6e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.936696  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.02 
 
 
283 aa  344  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3695  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  59.57 
 
 
281 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3019  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  58.87 
 
 
281 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2742  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  59.22 
 
 
281 aa  341  7e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3724  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  59.22 
 
 
281 aa  341  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359275  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3211  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  59.22 
 
 
281 aa  341  7e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.198924  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1762  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  59.22 
 
 
281 aa  341  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3753  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  59.22 
 
 
281 aa  341  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2792  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  59.22 
 
 
281 aa  341  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2711  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  59.93 
 
 
281 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027951  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.36 
 
 
283 aa  334  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3648  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  57.09 
 
 
281 aa  331  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0265  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  57.09 
 
 
281 aa  331  7.000000000000001e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3872  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  57.09 
 
 
281 aa  331  7.000000000000001e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4765  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  57.09 
 
 
281 aa  331  7.000000000000001e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03300  glycerol-3-phosphate transporter subunit  57.09 
 
 
281 aa  331  8e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03253  hypothetical protein  57.09 
 
 
281 aa  331  8e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3730  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  57.09 
 
 
281 aa  331  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3929  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  56.74 
 
 
281 aa  330  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3511  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.64 
 
 
281 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450535  normal  0.0797424 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.74 
 
 
281 aa  329  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3494  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  59.93 
 
 
281 aa  329  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0446  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  60.28 
 
 
281 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152206  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3757  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  56.74 
 
 
281 aa  327  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3824  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  56.74 
 
 
281 aa  327  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3746  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  56.74 
 
 
281 aa  327  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3926  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  56.74 
 
 
281 aa  327  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3867  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  56.74 
 
 
281 aa  327  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06398  ABC-type sugar transport system permease  57.39 
 
 
282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.93 
 
 
282 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1266  SN-glycerol-3-phosphate transmembrane ABC transporter protein  61.84 
 
 
282 aa  325  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75502  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3288  ABC glycerol-3-phosphate transporter, inner membrane subunit UgpE  59.58 
 
 
287 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.51 
 
 
282 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000209933 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3854  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  56.03 
 
 
281 aa  321  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0127  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  58.51 
 
 
281 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0119  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  58.16 
 
 
281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3283  hypothetical protein  58.54 
 
 
282 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.51 
 
 
287 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.340466  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3859  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  57.45 
 
 
282 aa  315  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4043  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  58.16 
 
 
282 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2095  sn-glycerol-3-phosphate ABC transporter, binding protein inner membrane component  58.1 
 
 
282 aa  311  5.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.565936 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0619  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  61.7 
 
 
282 aa  311  7.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.06 
 
 
282 aa  311  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.606554  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0657  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  61.35 
 
 
282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.47 
 
 
278 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.09 
 
 
281 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12847  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0347  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  55.83 
 
 
283 aa  288  8e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.2 
 
 
306 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1694  hypothetical protein  49.82 
 
 
275 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1695  hypothetical protein  49.46 
 
 
275 aa  278  8e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
306 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.493685 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1157  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  48.06 
 
 
280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0357  ABC transporter membrane spanning protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  49.64 
 
 
280 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5505  ABC transporter membrane spanning protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  43.05 
 
 
295 aa  257  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.37 
 
 
304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.62 
 
 
305 aa  248  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059569  normal  0.144695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
304 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4504  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.76 
 
 
297 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.369097  normal  0.590311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0662  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 
297 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
291 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0439942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
305 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
288 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.930102 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0553602  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
279 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
270 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
291 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.86109 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
270 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
277 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>