60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1832 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  95 
 
 		 180 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  75.42 
 
 		 180 aa  291  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  75 
 
 		 183 aa  283  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  74.44 
 
 		 183 aa  283  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  72.78 
 
 		 181 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  73.18 
 
 		 183 aa  280  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  72.63 
 
 		 183 aa  280  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  72.07 
 
 		 183 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  70.39 
 
 		 182 aa  269  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  72.73 
 
 		 185 aa  268  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  41.57 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  40.11 
 
 		 194 aa  124  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.78 
 
 		 279 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.87 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.22 
 
 		 227 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.73 
 
 		 178 aa  101  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.26 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.26 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.81 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.97 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.97 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.81 
 
 		 215 aa  72  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  29.05 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01810  conserved hypothetical protein  35.79 
 
 		 602 aa  59.3  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  26.49 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  25.4 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1154  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.12 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259101  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  29.75 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  25.65 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  25.65 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  25.16 
 
 		 281 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  25.16 
 
 		 281 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  25.16 
 
 		 281 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  25.16 
 
 		 281 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  24.86 
 
 		 207 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  24.86 
 
 		 207 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  24.86 
 
 		 207 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  25.16 
 
 		 281 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  24.86 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  24.86 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.99 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  24.18 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  24.18 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  25.13 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  24.52 
 
 		 281 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  28.03 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  24.52 
 
 		 281 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  25.36 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  26.82 
 
 		 1367 aa  46.6  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  26.82 
 
 		 1367 aa  46.6  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  29.61 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0780  exonuclease  25.44 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  23.23 
 
 		 281 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  22.58 
 
 		 281 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1384  Rad3-related DNA helicase  28.57 
 
 		 797 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000241  DNA polymerase III alpha subunit  25.44 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0549  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.65 
 
 		 342 aa  42.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.860226  hitchhiker  0.000115657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.12 
 
 		 930 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.01 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>