56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_4620 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  100 
 
 
207 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  98.55 
 
 
207 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  98.55 
 
 
207 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  98.55 
 
 
207 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  98.55 
 
 
207 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  97.1 
 
 
207 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  97.1 
 
 
207 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  95.17 
 
 
207 aa  407  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  95.17 
 
 
207 aa  407  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  95.17 
 
 
207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  85.51 
 
 
207 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  55.61 
 
 
206 aa  254  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  37.36 
 
 
209 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.75 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.34 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.51 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.8 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 
279 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.2 
 
 
178 aa  62  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  24.85 
 
 
201 aa  61.6  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.26 
 
 
182 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.65 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  27.53 
 
 
194 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.8 
 
 
181 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  28.57 
 
 
1390 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  29.21 
 
 
1362 aa  56.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.14 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.57 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  27.03 
 
 
183 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  29.03 
 
 
281 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  29.03 
 
 
281 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  26.2 
 
 
192 aa  54.7  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  29.03 
 
 
281 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  29.03 
 
 
281 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  29.22 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  27.92 
 
 
281 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  26.09 
 
 
180 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  29.49 
 
 
281 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  24.86 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  25.4 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  24.86 
 
 
185 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  29.5 
 
 
242 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  27.1 
 
 
281 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  28.39 
 
 
281 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  25.97 
 
 
1367 aa  45.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  25.81 
 
 
1407 aa  45.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  25.97 
 
 
1367 aa  45.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2121  exonuclease family protein  22.77 
 
 
300 aa  45.1  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  27.22 
 
 
1365 aa  45.1  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2409  exonuclease family protein  22.89 
 
 
300 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.16874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  25.32 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01810  conserved hypothetical protein  46.51 
 
 
602 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.81 
 
 
595 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  25.27 
 
 
1465 aa  42.4  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  27.01 
 
 
1433 aa  42  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  26.84 
 
 
1421 aa  41.6  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>