44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_44130 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  96.15 
 
 		 183 aa  354  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  76.67 
 
 		 180 aa  288  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  75 
 
 		 181 aa  283  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  75.27 
 
 		 182 aa  276  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  75.69 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  74.16 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  71.27 
 
 		 183 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  71.43 
 
 		 183 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  72.22 
 
 		 181 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  69.23 
 
 		 183 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  43.82 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  39.78 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  40.45 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  38.89 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  38.12 
 
 		 227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.56 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.6 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.73 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.26 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.22 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.09 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  28.65 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  27.47 
 
 		 281 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  26.37 
 
 		 281 aa  62  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  29.71 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  28.02 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  28.02 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  28.02 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  28.02 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  28.27 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  25.7 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  26.37 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  25.99 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  24.86 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01810  conserved hypothetical protein  36.56 
 
 		 602 aa  55.5  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1154  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.41 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259101  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  27.81 
 
 		 176 aa  48.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  27.97 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.24 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.05 
 
 		 930 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0780  exonuclease  29.07 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.06 
 
 		 219 aa  41.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1027  DNA polymerase III subunit epsilon  26.2 
 
 		 254 aa  40.8  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.512461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>