30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01810 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE01810  conserved hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1240    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  37.62 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.54 
 
 
279 aa  65.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.67 
 
 
227 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  37.23 
 
 
180 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.86 
 
 
181 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  35.79 
 
 
181 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  38.71 
 
 
185 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  40 
 
 
182 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.05 
 
 
178 aa  57.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  37.63 
 
 
183 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  33.04 
 
 
194 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.87 
 
 
201 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  36.56 
 
 
183 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.78 
 
 
183 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  38.71 
 
 
183 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  37.63 
 
 
183 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  35.79 
 
 
180 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  53.49 
 
 
207 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  53.49 
 
 
207 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.37 
 
 
188 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.04 
 
 
186 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  48.84 
 
 
207 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  48.84 
 
 
207 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  48.84 
 
 
207 aa  47.4  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  46.51 
 
 
207 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  46.51 
 
 
207 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  46.51 
 
 
207 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  46.51 
 
 
207 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  46.51 
 
 
207 aa  43.9  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>