48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2192 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 186 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  34.78 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  31.32 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  30.22 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.49 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  28.65 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  30.39 
 
 		 185 aa  84.7  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.78 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.05 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  26.97 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  29.67 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.09 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  28.09 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.02 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.19 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  27.32 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.21 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.6 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.05 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.5 
 
 		 215 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  28.8 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  28.8 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  28.8 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  26.34 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  28.8 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  28.18 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  29.57 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  29.57 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  28.8 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  34.82 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  27.57 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  27.57 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.73 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  30.13 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  30.13 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2409  exonuclease family protein  28.14 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.16874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2121  exonuclease family protein  28.14 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.91 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  28.85 
 
 		 281 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  28.85 
 
 		 281 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  28.85 
 
 		 281 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  28.85 
 
 		 281 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.49 
 
 		 180 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  26.71 
 
 		 281 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01810  conserved hypothetical protein  34.04 
 
 		 602 aa  47.8  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  27.98 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  27.66 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1356  hypothetical protein  28 
 
 		 86 aa  41.2  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.875905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>