37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1602 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 180 aa  366  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  62.21 
 
 		 196 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  54.97 
 
 		 188 aa  180  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  47.95 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  36.72 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  39.55 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  38.42 
 
 		 279 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.93 
 
 		 178 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  40.11 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  37.79 
 
 		 194 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  40.11 
 
 		 180 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  32.77 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  35.23 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  35.03 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1823  putative exonuclease  30.34 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  32.2 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.93 
 
 		 183 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.5 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  32.97 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  34.09 
 
 		 183 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35.56 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  34.09 
 
 		 183 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  34.44 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.36 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08055  RNA binding protein (Arp), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02160)  33.33 
 
 		 609 aa  57  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  26.44 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  25.15 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  26.44 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  26.86 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  26.86 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  26.86 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1356  hypothetical protein  38.36 
 
 		 86 aa  52.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.875905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.49 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  23.56 
 
 		 209 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81488  Asparagine-rich protein (ARP protein)  25 
 
 		 460 aa  45.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.771675  normal  0.0322455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  24.42 
 
 		 281 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>