33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02516 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  96.59 
 
 		 176 aa  358  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  85.23 
 
 		 176 aa  327  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1823  putative exonuclease  77.27 
 
 		 184 aa  288  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.42 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.29 
 
 		 196 aa  91.3  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.77 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.34 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.41 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  26.67 
 
 		 281 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  25.14 
 
 		 281 aa  61.6  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.34 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  29.31 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  26.37 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  25.82 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  26.67 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.23 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  25.56 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  25.56 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.64 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  25.56 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  25.56 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.74 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.07 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  29.75 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  29.07 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  30.67 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  29.75 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1356  hypothetical protein  34.78 
 
 		 86 aa  48.5  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.875905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  32.48 
 
 		 209 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  28.1 
 
 		 242 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0723  exonuclease, putative  26.77 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0715  putative exonuclease  27.34 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>