37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1823 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1823  putative exonuclease  100 
 
 		 184 aa  383  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  77.84 
 
 		 176 aa  289  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  77.27 
 
 		 176 aa  288  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  73.86 
 
 		 176 aa  283  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  34.5 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.34 
 
 		 180 aa  89  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.18 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.63 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  30.43 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.17 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  26.37 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  26.26 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  26.37 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.97 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  26.49 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  26.49 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  25.97 
 
 		 281 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  25.97 
 
 		 281 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  25.97 
 
 		 281 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  25.97 
 
 		 281 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  30.43 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1356  hypothetical protein  35.94 
 
 		 86 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.875905 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  29.27 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1122  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.97 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.046936  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.76 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  28.65 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.75 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  25.15 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2865  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3-5 exonuclease  21.25 
 
 		 207 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  27.82 
 
 		 242 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  26.32 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  26.32 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  27.45 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  25.95 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  25.15 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  30.4 
 
 		 566 aa  40.8  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.95 
 
 		 178 aa  40.8  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>