66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4730 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
181 aa  377  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  49.1 
 
 
196 aa  174  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.95 
 
 
180 aa  171  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.05 
 
 
188 aa  151  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  41.34 
 
 
192 aa  127  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.56 
 
 
201 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.23 
 
 
227 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.04 
 
 
178 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35.56 
 
 
279 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.3 
 
 
183 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  34.3 
 
 
183 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  32.56 
 
 
183 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  32.37 
 
 
183 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  33.71 
 
 
185 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  34.88 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  32.56 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  36.99 
 
 
176 aa  97.4  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  34.1 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1823  putative exonuclease  34.5 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.14 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  36.42 
 
 
176 aa  95.5  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  34.3 
 
 
182 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  28.81 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  28.81 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  29.07 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1356  hypothetical protein  46.91 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.875905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.05 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  31.74 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  27.62 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  28.81 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  28.66 
 
 
207 aa  61.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  28.74 
 
 
207 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  28.74 
 
 
207 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  28.74 
 
 
207 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  28.74 
 
 
207 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  28.74 
 
 
207 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  28.14 
 
 
207 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  28.14 
 
 
207 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  28.14 
 
 
207 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08055  RNA binding protein (Arp), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02160)  34.94 
 
 
609 aa  57.4  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  28.14 
 
 
207 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  25.27 
 
 
281 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  24.73 
 
 
281 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  24.86 
 
 
281 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  25.82 
 
 
281 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  25.14 
 
 
281 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  27.37 
 
 
1449 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2661  Exonuclease  29.32 
 
 
204 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0479324  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.17 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  26.86 
 
 
1433 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0715  putative exonuclease  26.47 
 
 
203 aa  45.1  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  26.82 
 
 
1449 aa  44.7  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81488  Asparagine-rich protein (ARP protein)  26.51 
 
 
460 aa  44.3  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.771675  normal  0.0322455 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  33.62 
 
 
1493 aa  44.3  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  23.5 
 
 
281 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2409  exonuclease family protein  26.14 
 
 
300 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.16874  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  28.98 
 
 
1367 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0723  exonuclease, putative  27.48 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  23.5 
 
 
281 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  23.5 
 
 
281 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  28.98 
 
 
1367 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  23.5 
 
 
281 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2121  exonuclease family protein  26.14 
 
 
300 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  24.16 
 
 
1407 aa  41.2  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  24.29 
 
 
578 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.01 
 
 
610 aa  40.8  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>