115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0507 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2121  exonuclease family protein  36.98 
 
 		 300 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2409  exonuclease family protein  36.46 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.16874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  31.79 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  32.31 
 
 		 281 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  32.31 
 
 		 281 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  32.31 
 
 		 281 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  32.31 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  31.79 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  32.31 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  31.79 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  30.77 
 
 		 281 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  30.9 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.9 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.9 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.34 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  30.38 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  27.27 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  27.81 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  30.57 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  29.67 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.5 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  27.94 
 
 		 1449 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.53 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.95 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  28.57 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  27.84 
 
 		 1449 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  28.41 
 
 		 1432 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  26.26 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  28.57 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0726  DNA polymerase III subunit epsilon  26.96 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  24.48 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  24.86 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  27.06 
 
 		 1442 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1341  DNA polymerase III subunit epsilon  28.04 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  26.99 
 
 		 1421 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.49 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  26.88 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  23.46 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  29.35 
 
 		 1397 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  25.3 
 
 		 1435 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  27.64 
 
 		 1433 aa  52.4  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  23.46 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  27.22 
 
 		 1407 aa  51.6  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  25.25 
 
 		 1433 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.41 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.54 
 
 		 960 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  28.19 
 
 		 1367 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.78 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  23.68 
 
 		 616 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  24.86 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  28.19 
 
 		 1367 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.47 
 
 		 956 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  35.05 
 
 		 1362 aa  49.3  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  24.24 
 
 		 1433 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  25.97 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  26.62 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  26.62 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0863  DNA polymerase III subunit epsilon  30.07 
 
 		 265 aa  48.5  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  20.67 
 
 		 645 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  23.74 
 
 		 1433 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  23.74 
 
 		 1433 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  23.74 
 
 		 1433 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  23.74 
 
 		 1433 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  23.94 
 
 		 1437 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  23.32 
 
 		 613 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2410  DNA-directed DNA polymerase  23.86 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00000352729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  23.74 
 
 		 1433 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  23.74 
 
 		 1433 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  21.56 
 
 		 578 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  23.74 
 
 		 970 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.73 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  25.15 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  26.67 
 
 		 1465 aa  47.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  28.12 
 
 		 1426 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  23.74 
 
 		 1433 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  23.74 
 
 		 1433 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.17 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1027  DNA polymerase III subunit epsilon  25.96 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.512461  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1154  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.75 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259101  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  26.49 
 
 		 1402 aa  45.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  20.69 
 
 		 279 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0502  DNA polymerase III subunit epsilon  30.12 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1750  DNA polymerase III subunit epsilon  25.56 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0163231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  25.32 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  25.32 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  25.32 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  25.32 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.46 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  27.81 
 
 		 1444 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000241  DNA polymerase III alpha subunit  25 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  25.73 
 
 		 1440 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02468  DNA polymerase III subunit epsilon  25.41 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.650155  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0222  exonuclease  25.61 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  25.32 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  25.12 
 
 		 1447 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1068  DNA polymerase III, epsilon chain  26.32 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.14 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  26.41 
 
 		 1390 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.62 
 
 		 944 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>