More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0110 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0110  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  983    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0119  UDP-glucose 6-dehydrogenase  83.19 
 
 
470 aa  804    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0273  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  51.21 
 
 
446 aa  475  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000204741  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1860  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.9 
 
 
430 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.25 
 
 
442 aa  147  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  30.34 
 
 
443 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0911  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.9 
 
 
449 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  30.53 
 
 
445 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1104  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.56 
 
 
449 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  29.62 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  29.27 
 
 
445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.51 
 
 
446 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.11 
 
 
447 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.22 
 
 
445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  25.96 
 
 
466 aa  136  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  27.53 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  31.31 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.57 
 
 
449 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.98 
 
 
473 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  28.77 
 
 
445 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  30.98 
 
 
473 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.98 
 
 
473 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.67 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3190  nucleotide sugar dehydrogenase  30.56 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  28.12 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.37 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  30.48 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.72 
 
 
442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2766  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.97 
 
 
442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.412534  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.47 
 
 
463 aa  131  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.82 
 
 
440 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2926  UDP-glucose dehydrogenase, putative  29.62 
 
 
442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0731315  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.82 
 
 
450 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  29.27 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3266  putative nucleotide sugar dehydrogenase  30.82 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.82 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.64 
 
 
466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  28.22 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.07 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.68 
 
 
448 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  27.53 
 
 
445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  33.52 
 
 
448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.22 
 
 
458 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.3 
 
 
466 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.3 
 
 
466 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  30.48 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  30.3 
 
 
466 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  28.62 
 
 
476 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0609  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.89 
 
 
436 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  29.24 
 
 
467 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  26.95 
 
 
441 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.52 
 
 
503 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.24 
 
 
467 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.32 
 
 
446 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01224  UDP-glucose dehydrogenase  26.46 
 
 
407 aa  124  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0873171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.66 
 
 
453 aa  124  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.97 
 
 
466 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  27.49 
 
 
449 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  29.97 
 
 
466 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  27.72 
 
 
464 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  29.63 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.83 
 
 
444 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.24 
 
 
470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  29.29 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.63 
 
 
470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  27.72 
 
 
464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  29.29 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.32 
 
 
436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.57 
 
 
482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  28.32 
 
 
436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  28.32 
 
 
435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.72 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.78 
 
 
446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  28.24 
 
 
482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.22 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.22 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  28.57 
 
 
470 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.29 
 
 
466 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.57 
 
 
470 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.57 
 
 
470 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  27.78 
 
 
446 aa  120  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.22 
 
 
440 aa  120  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  27.24 
 
 
448 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2696  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.3 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108367  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  27.05 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.15 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.07 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.43 
 
 
436 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.13 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.78 
 
 
447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  27.8 
 
 
447 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.83 
 
 
438 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  28.67 
 
 
453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.27 
 
 
467 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2891  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.13 
 
 
464 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0166748  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  27.67 
 
 
454 aa  116  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  26.99 
 
 
440 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  26.46 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0413  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.43 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.394208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.24 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>