More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0119 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0110  hypothetical protein  83.19 
 
 
476 aa  827    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0119  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
470 aa  969    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0273  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  53.33 
 
 
446 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000204741  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1860  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.4 
 
 
430 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0911  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.37 
 
 
449 aa  143  8e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1104  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.02 
 
 
449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  27.9 
 
 
450 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.93 
 
 
442 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  27.76 
 
 
440 aa  136  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2766  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.44 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.412534  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3190  nucleotide sugar dehydrogenase  30.56 
 
 
453 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.77 
 
 
447 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2926  UDP-glucose dehydrogenase, putative  28.12 
 
 
442 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0731315  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  28.48 
 
 
445 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  27.37 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  27.76 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  29.67 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3266  putative nucleotide sugar dehydrogenase  29.19 
 
 
453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.27 
 
 
446 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.95 
 
 
446 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  29.97 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  26.99 
 
 
443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.96 
 
 
445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.12 
 
 
440 aa  130  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.36 
 
 
442 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  28.12 
 
 
440 aa  129  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.35 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.21 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.22 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.11 
 
 
446 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  24.91 
 
 
466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.36 
 
 
503 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  26.32 
 
 
445 aa  128  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  28.88 
 
 
453 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  27.84 
 
 
449 aa  126  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  27.85 
 
 
464 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.68 
 
 
448 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.46 
 
 
450 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  27.85 
 
 
464 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  25.95 
 
 
441 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  26.1 
 
 
448 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  27 
 
 
447 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.13 
 
 
447 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  26.35 
 
 
436 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.35 
 
 
436 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  26.35 
 
 
435 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  27.08 
 
 
445 aa  124  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  27.72 
 
 
445 aa  123  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.96 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.88 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.41 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.96 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0609  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.62 
 
 
436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6075  nucleotide sugar dehydrogenase  27.53 
 
 
461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.17 
 
 
459 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.29 
 
 
473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  25.69 
 
 
436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0413  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.53 
 
 
440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.394208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  29.29 
 
 
473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.5 
 
 
444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.29 
 
 
473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.42 
 
 
447 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.33 
 
 
445 aa  120  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.95 
 
 
467 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  26.18 
 
 
445 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.28 
 
 
466 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.28 
 
 
466 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  26.17 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  28.28 
 
 
466 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.47 
 
 
440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.1 
 
 
446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01224  UDP-glucose dehydrogenase  25.68 
 
 
407 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0873171  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  26.1 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.46 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.97 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  25.71 
 
 
441 aa  118  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  26.9 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  28.78 
 
 
470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0495  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.81 
 
 
440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.156569  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  27.61 
 
 
467 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.42 
 
 
446 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.39 
 
 
436 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.97 
 
 
439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.83 
 
 
457 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2696  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.08 
 
 
464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108367  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.78 
 
 
473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.53 
 
 
442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.85 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  27.95 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.95 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  26.39 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  27.7 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.76 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  27.61 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.18 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.5 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  25.44 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  29.5 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.27 
 
 
466 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.42 
 
 
470 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>