More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6075 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6075  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
461 aa  926    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  53.64 
 
 
440 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.09 
 
 
442 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.77 
 
 
453 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.09 
 
 
457 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  54.09 
 
 
437 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  49.43 
 
 
440 aa  462  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  54.25 
 
 
435 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  53.86 
 
 
437 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.02 
 
 
436 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  51.03 
 
 
438 aa  460  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  54.25 
 
 
436 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.24 
 
 
450 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  51.21 
 
 
450 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  54.2 
 
 
454 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  50.57 
 
 
440 aa  455  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  51.35 
 
 
450 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  54.42 
 
 
454 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.59 
 
 
447 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.29 
 
 
438 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.45 
 
 
450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  53.3 
 
 
453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.91 
 
 
452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  51.36 
 
 
440 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.43 
 
 
457 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.93 
 
 
442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  51.36 
 
 
443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.05 
 
 
447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  53.29 
 
 
466 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.09 
 
 
447 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  50.56 
 
 
447 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.25 
 
 
503 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.86 
 
 
473 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.1 
 
 
437 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.75 
 
 
466 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  49.66 
 
 
451 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.22 
 
 
452 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.11 
 
 
457 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.1 
 
 
470 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.25 
 
 
440 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.79 
 
 
448 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  51.54 
 
 
470 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.29 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.54 
 
 
470 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  50.66 
 
 
467 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  53.29 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.1 
 
 
470 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.51 
 
 
473 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.29 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.54 
 
 
470 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  50 
 
 
445 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  51.1 
 
 
470 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.2 
 
 
442 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  48.51 
 
 
437 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.97 
 
 
445 aa  435  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  51.11 
 
 
476 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  51.14 
 
 
445 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  52 
 
 
450 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  51.25 
 
 
439 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  51.51 
 
 
473 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.55 
 
 
445 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.41 
 
 
466 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.32 
 
 
467 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.22 
 
 
457 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  50.68 
 
 
441 aa  437  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  52.53 
 
 
466 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.77 
 
 
446 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.86 
 
 
473 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  48.62 
 
 
438 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.36 
 
 
442 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.72 
 
 
449 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  50.21 
 
 
470 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.45 
 
 
446 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  49.56 
 
 
466 aa  433  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  50.88 
 
 
470 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.54 
 
 
466 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.33 
 
 
482 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  49.08 
 
 
436 aa  433  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  50.88 
 
 
482 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.7 
 
 
440 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.7 
 
 
440 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.14 
 
 
446 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.63 
 
 
466 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  50.68 
 
 
445 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.68 
 
 
440 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  49.23 
 
 
454 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.68 
 
 
445 aa  435  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.54 
 
 
466 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  50 
 
 
449 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.54 
 
 
466 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.54 
 
 
466 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  48.19 
 
 
444 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 
444 aa  431  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  47.6 
 
 
437 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.54 
 
 
466 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  47.6 
 
 
437 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.01 
 
 
454 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.54 
 
 
466 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.54 
 
 
466 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.53 
 
 
445 aa  428  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>