More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_R0001 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_R0001  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0729187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0064  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0324982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0066  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.572746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0029  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0046  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00122164  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1570  tRNA-Phe  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1596  tRNA-Phe  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250101  normal  0.561376 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1605  tRNA-Phe  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0111  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0238914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0075  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0044  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0078  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00739535  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1129  tRNA-Phe  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt29  tRNA-Phe  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt29  tRNA-Phe  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0999  tRNA-Phe  91.55 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2873  tRNA-Phe  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0053  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.744233  normal  0.828825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna102  tRNA-Phe  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna099  tRNA-Phe  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0048  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0059  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0046  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0022  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.688613  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3122t  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000556833  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0051  tRNA-Phe  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0676526  normal  0.132155 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03599  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3119t  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000473964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03596  tRNA-Phe  91.18 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0066  tRNA-Phe  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0346272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0063  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0010  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0007  tRNA-Phe  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572306 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0044  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000279545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0069  tRNA-Phe  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0044  tRNA-Phe  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0044  tRNA-Phe  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0738  tRNA-Phe  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0044  tRNA-Phe  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1216  tRNA-Phe  91.8 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.777454  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0011  tRNA-Phe  97.73 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  97.73 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0001  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0473028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0010  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00225756  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t12  tRNA-Phe  97.73 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0141221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0007  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0016  tRNA-Phe  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0028  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748301  normal  0.0311431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0010  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0001  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0826979  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0017  tRNA-Phe  97.73 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt23  tRNA-Phe  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0207  tRNA-Phe  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0208  tRNA-Phe  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0067  tRNA-Phe  91.53 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2870  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.65469e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03594  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03603  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2875  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.76547e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0001  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238457 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0054  tRNA-Phe  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0046  tRNA-Phe  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3124t  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000666953  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna097  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688692  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna104  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000422121  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPhe01  tRNA-Phe  87.84 
 
 		 79 bp  75.8  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3194t  tRNA-Phe  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0054  tRNA-Phe  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0007  tRNA-Phe  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.026745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t03  tRNA-Phe  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0091  tRNA-Phe  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373853 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.856426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.856426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0073  tRNA-Phe  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0022  tRNA-Phe  93.88 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0012  tRNA-Phe  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0023  tRNA-Phe  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0171  tRNA-Phe  97.56 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0039  tRNA-Phe  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0022  tRNA-Phe  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.052558  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0566  tRNA-Phe  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0036  tRNA-Phe  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0089  tRNA-Phe  90.16 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0060  tRNA-Phe  90.16 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456959  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4139  tRNA-Phe  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.32664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4150  tRNA-Phe  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0016  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000022275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0191  tRNA-Phe  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.285642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0250  tRNA-Phe  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1867  tRNA-Phe  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2455  tRNA-Phe  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0046  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0034  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000464813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0046  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0034  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000084098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>