299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0015 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0067  tRNA-Phe  97.33 
 
 		 76 bp  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0091  tRNA-Phe  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000501054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna099  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna102  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2873  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4989  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5677  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000587579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5701  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000879841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5718  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0125  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00709498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 79 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0172101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 79 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000144238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 79 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000285644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 79 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00368235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 79 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 79 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000275824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 79 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 79 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000662061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0867  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 78 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000451137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000296401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4771  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000230747  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0111  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0080  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000066232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5020  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00210794  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0028  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748301  normal  0.0311431 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0107  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00870398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5739  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 78 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0226  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0084  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0072  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00159323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0531  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37377e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0129  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.396615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0084  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000702597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0606  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000109662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5805  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00212001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5712  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 76 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0792  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 78 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67263e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4564  tRNA-Phe  94.59 
 
 		 78 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000213721  normal  0.0844517 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3119t  tRNA-Phe  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000473964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03596  tRNA-Phe  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03599  tRNA-Phe  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3122t  tRNA-Phe  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000556833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5734  tRNA-Phe  95.59 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.086829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5573  tRNA-Phe  95.59 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26339e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0145  tRNA-Phe  95.59 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000807799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  95.59 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000520141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  95.59 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  95.59 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000306908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5345  tRNA-Phe  95.59 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000017112  hitchhiker  0.00000000000596861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5830  tRNA-Phe  95.59 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0216141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  95.59 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5651  tRNA-Phe  95.59 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0086  tRNA-Phe  94.44 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0055  tRNA-Phe  94.44 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0039  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0149  tRNA-Phe  95.59 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  95.52 
 
 		 79 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00153582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  95.52 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0161647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0002  tRNA-Phe  94.37 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0059  tRNA-Phe  96.83 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0002  tRNA-Phe  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0043  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0013  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596059  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  98.21 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0005  tRNA-Phe  93.06 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  98.21 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0047  tRNA-Phe  96.67 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPhe01  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02241  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000057797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2797  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0058  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0354  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.570155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0002  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113905  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0136  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.740325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0044  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0054  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0046  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0044  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0159  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.369913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2283  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00760405  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0021  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0070  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00525701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0006  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0062  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2361  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.979776  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0044  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0169  tRNA-Phe  95.24 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0059  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.119328  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0145  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03603  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0001  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3194t  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2870  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.65469e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3124t  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000666953  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2875  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.76547e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>