More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0055 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0055  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0086  tRNA-Phe  98.61 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5739  tRNA-Phe  96.88 
 
 
78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5677  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000587579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5701  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000879841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5718  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5734  tRNA-Phe  96.88 
 
 
73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.086829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0792  tRNA-Phe  96.88 
 
 
78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67263e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0107  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00870398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0080  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000066232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  94.44 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00153582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000520141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0172101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000144238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000285644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00368235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000275824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000306908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  96.88 
 
 
79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000662061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0531  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37377e-30 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5573  tRNA-Phe  96.88 
 
 
78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26339e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0084  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0084  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000702597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0111  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00210524  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000451137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000296401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0161647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  96.88 
 
 
73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5651  tRNA-Phe  96.88 
 
 
78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4771  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000230747  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5712  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5805  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00212001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0149  tRNA-Phe  96.88 
 
 
73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133419  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0001  tRNA-Phe  100 
 
 
73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5830  tRNA-Phe  96.88 
 
 
78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0216141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0226  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5345  tRNA-Phe  96.88 
 
 
78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000017112  hitchhiker  0.00000000000596861 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4989  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0005  tRNA-Phe  94.44 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0606  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000109662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0125  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00709498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4564  tRNA-Phe  96.88 
 
 
78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000213721  normal  0.0844517 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0072  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00159323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0145  tRNA-Phe  96.88 
 
 
73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000807799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0867  tRNA-Phe  96.88 
 
 
78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0129  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.396615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5020  tRNA-Phe  96.88 
 
 
76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00210794  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0145  tRNA-Phe  94.37 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0059  tRNA-Phe  94.37 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.119328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0067  tRNA-Phe  98.31 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184949  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0002  tRNA-Phe  94.37 
 
 
76 bp  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113905  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0013  tRNA-Phe  96.72 
 
 
76 bp  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596059  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0006  tRNA-Phe  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0241224  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0045  tRNA-Phe  98.21 
 
 
73 bp  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0046  tRNA-Phe  98.21 
 
 
73 bp  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.300916  normal  0.216721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0006  tRNA-Phe  98.21 
 
 
73 bp  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201329  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0091  tRNA-Phe  93.06 
 
 
76 bp  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000501054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0052  tRNA-Phe  92.96 
 
 
76 bp  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000909923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0053  tRNA-Phe  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.744233  normal  0.828825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0059  tRNA-Phe  95.24 
 
 
76 bp  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  96.55 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0406321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  95.16 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0011  tRNA-Phe  95.16 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443176  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0111  tRNA-Phe  93.75 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0238914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0078  tRNA-Phe  93.75 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00739535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0044  tRNA-Phe  93.75 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0048  tRNA-Phe  95 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0075  tRNA-Phe  93.75 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5887  tRNA-Phe  91.55 
 
 
78 bp  93.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0007  tRNA-Phe  93.65 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0572306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0066  tRNA-Phe  93.65 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0346272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0069  tRNA-Phe  93.65 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178252  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0076  tRNA-Phe  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  hitchhiker  0.00000000192681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0063  tRNA-Phe  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0046  tRNA-Phe  96.3 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00122164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60620  tRNA-Phe  93.55 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.787941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0046  tRNA-Phe  93.55 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0010  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00225756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0007  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0001  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000236291  normal  0.254475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60610  tRNA-Phe  93.55 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.820326  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0041  tRNA-Phe  93.55 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0010  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0029  tRNA-Phe  96.3 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68030  tRNA-Phe  93.55 
 
 
73 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351538  hitchhiker  0.008643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0001  tRNA-Phe  94.83 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0826979  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0068  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0061  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000000629248  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0014  tRNA-Phe  94.64 
 
 
73 bp  87.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000072957  hitchhiker  0.009028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0060  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000308543  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna30  tRNA-Phe  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.319262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0059  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0003  tRNA-Phe  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.22263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0039  tRNA-Phe  90.28 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  94.64 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>