More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2873 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2873  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna102  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna099  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03596  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03599  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3119t  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000473964  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3122t  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000556833  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPhe01  tRNA-Phe  97.37 
 
 		 79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2870  tRNA-Phe  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.65469e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2875  tRNA-Phe  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.76547e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna104  tRNA-Phe  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000422121  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna097  tRNA-Phe  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688692  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3124t  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000666953  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3194t  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03603  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03594  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0091  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000501054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0010  tRNA-Phe  94.37 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0007  tRNA-Phe  94.37 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0010  tRNA-Phe  94.37 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00225756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0001  tRNA-Phe  94.37 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0826979  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0044  tRNA-Phe  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0046  tRNA-Phe  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0044  tRNA-Phe  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0044  tRNA-Phe  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0193  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0260  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2156  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2770  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0191  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.285642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0250  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1867  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2455  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0054  tRNA-Phe  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0039  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0036  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000856432  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0024  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0063  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0012  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0007  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.026745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0067  tRNA-Phe  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0006  tRNA-Phe  96.61 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0062  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.205549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0091  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t03  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 73 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5677  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000587579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5701  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000879841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5718  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0072  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00159323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0084  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000702597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5712  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0867  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5739  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0792  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67263e-33 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0172101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000144238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000285644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00368235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000275824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000662061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0107  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00870398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0606  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000109662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0125  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00709498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0080  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000066232  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0016  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0226  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000451137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000296401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0047  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5020  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00210794  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0071  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762598  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0016  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000022275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0028  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748301  normal  0.0311431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0059  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5805  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00212001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4771  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000230747  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4564  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000213721  normal  0.0844517 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4989  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0531  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37377e-30 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0017  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0026  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.981393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0084  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0111  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00210524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0129  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.396615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0085  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0384171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0087  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0032  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000122273  normal  0.272295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0025  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140314  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t079  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  95.08 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  95.08 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000306908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0139  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457093  normal  0.0810294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0030  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000136397  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0032  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0102  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000613191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0108  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000869293  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0102  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>