More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0060 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0060  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456959  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_002950  PGt23  tRNA-Phe  98.18 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0067  tRNA-Phe  95.08 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5712  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5677  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000587579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5701  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000879841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5718  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5020  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00210794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0129  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.396615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0044  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0172101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000144238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000285644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00368235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000275824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000662061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0226  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0080  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000066232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0111  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00210524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0792  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67263e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0867  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000451137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000296401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5805  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00212001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5739  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0531  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37377e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4771  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000230747  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0606  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000109662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0111  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0238914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0084  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0072  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00159323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0078  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00739535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0075  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0084  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000702597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4564  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000213721  normal  0.0844517 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0107  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00870398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0125  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00709498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4989  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5573  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26339e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5734  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.086829  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0023  tRNA-Phe  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00153582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000520141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000306908  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0059  tRNA-Phe  94.92 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5345  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000017112  hitchhiker  0.00000000000596861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5651  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-3  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0161647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Phe-4  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5830  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0216141  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0053  tRNA-Phe  94.92 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.744233  normal  0.828825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0149  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0145  tRNA-Phe  93.65 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000807799  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0091  tRNA-Phe  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000501054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0028  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0020  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000566617  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0048  tRNA-Phe  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0015  tRNA-Phe  93.44 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.689116  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0171  tRNA-Phe  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0028  tRNA-Phe  92.19 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0066  tRNA-Phe  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0346272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0007  tRNA-Phe  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0069  tRNA-Phe  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0055  tRNA-Phe  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0086  tRNA-Phe  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0059  tRNA-Phe  93.22 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0109  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000406559  normal  0.781689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0091  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0102  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000178571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0133  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.091812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0023  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00944199  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0059  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.119328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t091  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0025  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0032  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000122273  normal  0.272295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0093  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0030  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000136397  normal  0.27905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0139  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457093  normal  0.0810294 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0002  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113905  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t030  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00416804  normal  0.0398749 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0102  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000613191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t100  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000153181  normal  0.0304774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0039  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000106148  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0047  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0051  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0053  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0124  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101919  normal  0.131047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0052  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0041266  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0054  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.743391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0124  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000733103  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0026  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0580747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0112  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0390211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0045  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t028  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00444384  normal  0.0406037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0020  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00333528  normal  0.963611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0043  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000783978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>